顺治三年（1646）六月十一日，吏科给事中林起龙上《请速禁异端讹言疏》。他指出：入清后，兴盛于明代的各种民间教派，如白莲、大乘、混元、无为等峰起。它们聚众招群，以烧香礼忏秘密联络，“煽惑人心”，有的则与农民军结合在一起，成为抗清的重要军事。如不加严行禁止，必将导致政局不稳。清统治者对林起龙的建言十分重视，立即命都察院、五城御史、巡捕衙门及各省督抚、按察使等官：如遇各色教门，即行严捕，处以重罪，做为防微杜渐之计。从此，清廷开始了对“邪教”十分严酷的镇压。