乾隆二十五年（1760）八月，清廷授阿桂为都统，命总理伊犁事务。阿桂，字广廷，满洲正蓝旗（后隶正白旗）人，大学士阿克敦之子。先是，讷亲督师讨金川，奏请以阿桂参军事。及讷亲获罪，提督岳钟琪并劾阿桂，逮部治罪，后得释。准部叛乱，命阿桂赴乌里雅苏台，与靖边将军成衮扎布搜讨准部逸兵，遇事奋勉，始渐任用。准部平定，又从富德合剿回众，至是还伊犁。西域既平，地方万余里，必须驻兵镇守。命各军营大臣等议，皆谓其地院，难驻守。阿桂独上言：“守边以驻兵为先，驻兵以军食为要。臣观伊犁海努克（今伊宁县南）等处水土沃衍，且有河可引灌注，若开垦屯田，则兵食可渐充。”乃上屯田方略：一、请增派回人屯田；二、请官兵驻防协同垦种；三、请建置成郭；四、请预备马驼。乾隆帝嘉其勇往任事，即如所议行。阿桂总理伊犁事务后，酌留马匹，分设台站，以通文报往来。不久，又请将沿边运出粮米俱赴伊犁，简各省军流人犯中能工匠技艺者悉发伊犁，以备任使。后阿桂步行农器、促屯耕种，岁获大丰。