嘉庆五年(1800年),七十六岁高龄的王杰以年老体衰乞请解职,嘉庆帝下诏挽留,并特许他拄杖入朝。三年后,他辞职还乡,临行前还专门上书请求解决政治上的腐败问题,并提出通过吏治整顿堵塞国家财政上的漏洞。王杰辞职离京之日,嘉庆帝赐给他一把乾隆御用过的手杖和御制诗两首,以表尊敬和器重。
嘉庆九年(1804年),王杰八十岁生日,巡抚方维甸带着嘉庆帝的贺诗,题匾和所赐珍宝登门拜贺,他赴京答谢,不久即病逝于北京。嘉庆帝治祭文,赐银两千两,着荣亲王治丧,赠太子太师,谥号文端,入祀贤良祠。祠联为:“文见长,清风两袖,不畏权贵;端品高,言道一身,敢斥恶邪。