嘉靖二十九年（1550年）复巡按顺天，筑京师外郭（永定门城），修建通州城，建筑张家湾大小二堡。当年，俺答大举攻扰古北口。忬按顺天，言潮河川有小路一日夜可达通州。即驰至通州，尽徙东岸船只。鞑靼兵至，不得渡。擢右佥都御史。
嘉靖三十一年（1552年）出抚山东，甫三月，以浙江倭寇告急，出任提督军务，巡抚浙江及福、兴、漳、泉四府，任用俞大猷、汤克宽等加强防御，立有战功。
嘉靖三十二年（1553年），王忬进右副都御史，巡抚大同，加兵部右侍郎，代苏辽总督，不久，进右都御史。而王忬的儿子王世贞复失欢于严嵩和严世蕃。忠臣杨继盛死难，王世贞经济其丧事，遭到严嵩父子大恨。而所部屡失事，渐失世宗信任。
嘉靖三十八年（1559年），鞑靼兵大举深入，留内地五日，俺答汗进犯潘家口长城，滦河以西（遵化县、迁安县、蓟州、玉田县）告急。御史王渐、方辂趁机弹劾王忬等人的失职之罪。明世宗大怒，严厉责问了王忬，下令停俸思过。至五月，方辂再次复弹劾王忬失策者三，可罪者四，皇帝遂下令逮捕王忬及中军游击张伦，下诏狱
