康熙二十四年（1685），纳兰性德因病去世，终年三十一岁。纳兰性德，原名成德，字容若，满洲正黄旗人，大学士明珠长子。他好读书，爱骑射，善长诗词。年二十二岁，考中进士，官至一等侍卫。著有《纳兰词》，很有影响。另有《通志堂集》、《湛园文稿》、《全唐诗选词韵正略》等。还与徐乾学编刻《通志堂经解》，一千八百余卷。

康熙二十四年（1685），清廷定八旗户下家人赎身例。规定：凡八旗户下家人，如主念其数辈效力，自愿放为民；如主不能瞻养，愿令具赎身为民，俱呈明本旗报部，转行地方官收入民籍，子孙各依该籍民人办理。倘有以他人名认买擅自出旗，或将子孙私入民籍者，照例治罪，仍归其主。

康熙二十四年（1685）二月初七日，康熙帝批准广西道御史钱珏疏言，命各省确查平定三藩之乱时投诚者的安置情况。钱珏题请务使他们各得其所。愿在他乡入籍者，写明作何生计；愿屯田者，编入保甲，官给牛种，拨给开垦田亩；愿为兵者，补入营伍。

康熙二十四年（1685）九月十五日，监察御史钱珏弹劾山西巡抚穆尔赛不仅多加文水等县火耗，而且在嫁女时强索属官礼物。革职通判张谦勾结穆尔赛家人，借机妄诈属官财贿。康熙帝命将穆尔赛提至京师，严加审问。谕以“即今居官者，更有如穆尔赛贪污者乎？！如此文人，尚谓其不生事，嗣后九卿何可信用。”二十三日，因九卿会议穆尔赛强索礼物等事，再谕大学士等，斥责不据实俱议，苟且草率，致使地方官员横行无忌。强调“治天下以惩贪奖廉为要，嗣洁者奖一以劝众，贪婪者惩一以儆百。”十一月十四日，穆尔赛处以绞监候。

康熙二十五年（1686）三月初五日，康熙帝命纂修《一统志》，以大学士勒德洪等七人为总裁官，原任左都御史徐元文、内阁学士徐乾学等六人为副总裁官，翰林院侍读彭孙遹等二十人为纂修官。命陈廷敬和徐乾学专理管务。《一统志》始于元代，分省记录全国的自然与社会风情，即总括各地方志。康熙二十九年（1690）十二月，康熙帝准徐乾学请假省墓时，将《一统志》等书带归编辑。

康熙二十五年（1686）十一月十六日，康熙帝亲笔书写“学达性天”四字匾额，颁发宋代名儒周敦颐、张载、程颢、程颐、邵雍、朱熹祠堂及白鹿洞书院。另以此匾颁给张栻、朱熹曾讲学的长沙岳麓书院。

康熙二十五年（1686）正月十九日，云贵总督蔡毓荣题报苗民王腾龙等聚众劫掠，应行征剿。对此，康熙帝谕大学士：苗民赋性朴实，如其生事，皆因地方官不据情抚恤，反而强行索取马匹、金银等物，诛示不已，遂生衅端！前此吴三桂时，因其对苗民不断勒派，也有此类事发生。二月二十三日，严斥蔡毓荣等云贵、四川、广西各官对苗民“不唯不善加抚绥，更尔恣意苛虐！”命九卿等会议立法，令这些官员痛改前非，对苗民推诚示信，遵其习俗，化导安辑，使其乐业。

康熙二十五年（1686）四月初一日，理藩院疏言：达赖喇嘛所遣噶尔丹西勒图，约于本年闰四月至喀尔喀墨尔根台吉处，应遣大臣莅盟。康熙帝命理藩院尚书阿喇尼等四人前往。另遣员分赴右翼扎萨克图汗、额尔德尼济农盆楚克拉布坦、色冷阿海台吉、达尔玛希礼、遵义盆楚克台吉、额尔克济农、左翼土谢图汗哲布遵丹巴胡图克图、车臣汗、信顺厄尔克戴青、墨尔根济农诸处。复在敕谕中强调“中外一体，务使交相辑睦，共享升平”。并分析了左、右翼扎萨克之间的矛盾，希望通过阿喇尼和达赖喇嘛使者共同主持的喀尔喀蒙古诸部的会盟，尽释旧怨，照旧安居。是时，喀尔喀右翼扎萨克图汗死，其子噶尔旦台吉请袭父职。康熙帝允准，命阿喇尼就便往祭。

康熙二十六年（1687）二月十六日，刑科给事中刘楷请禁淫词小说，康熙帝谕示说：淫词小说，人所乐观，实能败坏风俗，蛊惑人心。遂令严行禁止。

康熙二十六年（1687）三月初七日，康熙帝批准大学士等奏请，调整全国总督建置，合并浙江总督、福建总督为浙江福建总督，另有五个总督是江南江西、广东广西、云南贵州、湖南湖北、四川陕西。直隶、山西、山东、河南等省不设总督，而设巡抚。