康熙三十五年（1696），著名学者颜元开始主持漳南书院。颜元，字易直，号习斋，河北博野县人。他八岁跟随僧人吴持明学习骑射剑戟及攻守兵法，后来又学习八股文，应考县试，曾说：“宁为真白丁，不作假秀才。”从二十三岁起，颜元开始办学墪教授子弟；与此同时，潜心学问，专攻理学，孜孜不倦，终于成为清代前期著名的启蒙思想家和教育家。颜元主持漳南书院工作时，已经六十二岁。他认为讲学应该广博，注意实践。他大胆提议改建漳南书院格局，建正厅三间，名为“习讲堂”。讲授武备，学习黄帝、太公及孙吴诸子兵法、攻守营阵、陆水战法并射御技击；讲授经史，学习十三经、历代诰制、章奏、诗文；讲授艺能，学习水学、火学、工学、象数。为了应付时制，还另设二科，一是静坐科，主要编著程朱陆王之学；另一为帖括科，学习八股举业时艺。这两科均不是主科。颜元还在习讲堂正厅大书楹联一幅：“聊存孔绪励习行，脱云乡愿、禅宗、训诂、帖括之套；恭体天心学经济，斡旋人才、政事、道统、气数之机。”颜元提倡的教育内容和文法，在当时具有新意；漳南书院的改制，在颜元一生中也占有重要地位。颜元主持漳南书院仅半年时间。同年八月中旬，漳水漫堤，发生水灾，漳南一带全部淹没，书院也荡然无存。由于资财有限，无力再举，颜元不得不怅然返家。他以教育振兴民族的理想遂未能实现。

康熙五十七年（1718）五月二十八日，康熙朝理学名臣李光地病逝，终年七十七岁。李光地，字晋卿，号榕村，福建安溪人。康熙朝初年，他考中进士后，选翰林院庶吉士，后授编修。耿精忠叛乱期间，他正回乡省亲，为平定三藩之乱，特上蜡丸密疏，被康熙帝称为忠臣。在统一台湾过程中，他推荐内大臣施琅为取台主帅，并认为只有施琅才能胜此重任，施琅后来果然不负厚望，终于统一了台湾。李光地的正确主张受到康熙帝高度赞赏。康熙帝对李光地的学识非常欣赏，有时几天之内就多次召问。他任会试考官，与其他考官一起革除弊政；奉命视察河情，便绘图呈进，提出治理办法；康熙帝重视人才，他便推荐陆陇其等人。他在任直隶巡抚期间，从安民为要，勘治漳河，宁息水患，亲督官吏，扑灭蝗灾，对于各地灾民，贷以牛种，请免赋税。特别是兴修水利，政绩突出，曾经带病工作，受到康熙帝嘉奖。除直隶巡抚外，李光地还曾任职通政使司通政使、兵部右侍郎、吏部尚书等。康熙帝为巩固清初的统治，亲自提倡程朱理学。李光地深明其意，所以在侍讲和修书等场合中都分外卖力。他称朱熹之功可以和日月争光，对康熙帝信仰朱子，索性不发朱子书回非常高兴。他所校理的《御纂朱子全书》、《周易折中》、《性理精义》成为清代官方书籍。康熙帝经常召他进入便殿，相互探讨程朱理学。李光地死后，康熙常曾伤感地说：大臣中了解朕心思的没有人能比得上李光地。

光绪二十四年（1898）四月二十八日，光绪皇帝召见康有为，康力陈八股之弊。二十九日，康有为、宋伯鲁又上疏请改八股为策论。五月初五日，光绪帝发布“上谕”：自下科始，乡会试及生童岁科各试，一律废八股，改试策论。戊戌政变后，八月二十四日，清廷宣布恢复旧制，仍以四书文、试帖等项分别考试。光绪二十七年（1901）七月，又下诏：自明年始，乡会试均不准用八股文程式。光绪三十一年（1905）八月，清廷正式宣布彻底废除科举考试制度，推行新式学堂。

光绪二十四年（1898），康有为先后奏上《请开学校折》、《请饬各省改书院淫祠为学堂折》。根据康有为的一再吁请，光绪帝于五月二十二日发布“上谕”，命改各地书院为兼习中学、西学之学校，以省会之大书院为高等学堂，郡城之书院为中等学堂，州县之书院为小学；凡不在祀典之民间祠庙，亦一律改为学堂。戊戌政变后，新政中辍。光绪二十七年（1901），清廷再令各省、府、州、县设立学堂，“作育人才”。光绪二十八年正月（1902），又谕将宗室、觉罗、八旗等官学改设中、小学堂，并归入大学堂办理；各省驻防官学、书院一律改为小学堂。

光绪二十四年（1898）正月，光绪皇帝根据御史王鹏运的建议，命军机大臣与总理衙门大臣会商开办京师大学堂事宜。四月二十三日，颁发“明定国是”诏，宣布变法维新。五月十五日，总理衙门奏上京师大学堂章程，京师大学堂正式成立。派吏部尚书孙家鼐为管学大臣，管理大学堂事务。张元济为总办（后由黄绍箕、余诚格继任），许景澄为总教习，美国人丁韪良为西文总教习。初以“广育人才，讲求时务”为宗旨，议设道学、政学、农学、工学、商学等十科。戊戌政变后，实际只办了诗、书、易、礼四堂及春秋两堂，学生不及百人，性质仍与旧时书院无异。光绪二十六年（1900）八国联军攻陷北京后停办。光绪二十八年（1902）复校，设预备科（政科、艺科）、速成科（仕学馆、师范馆）。次年增设医学馆、译学馆及进士馆。毕业生分别授给贡生、举人、进士头衔。宣统二年（1910），改设为经、法、文、格致、农、工、商七科。

光绪二十七年（1901）十二月，清政府任张百熙为京师大学堂管学大臣，并命他裁定学堂章程具奏。光绪二十八年（1902）七月十二日，张百熙进呈《京师大学堂章程》、《考选入学章程》、《高等学堂、中学堂、小学堂章程》以及《蒙学章程》各一份，共六件，候旨颁行。这些章程对辛丑年以后清政府设立的各级各类学堂的学制、入考方式、教学内容等，做出一一些系列规定，是中国近代学堂教育体系整体设计的最初方案。进呈当日，即由清政府颁行，被称为钦定学堂章程。

光绪二十七年（1901）二月十二日，中国近代著名科学家徐建寅不幸逝世。徐建寅生于道光二十五年（1845），其父是晚清著名科学家徐寿，曾翻译了《汽机发轫》、《化学鉴原》等近代科学著作，为近代化学在中国的传播做出了巨大贡献。徐建寅自幼追随其父，耳闻目濡，参加实验，对近代自然科学产生了浓厚的兴趣。同治二年（1863），他协助其父完成了木壳轮船“黄鹄号”的制造。同治五年（1866），徐寿受命襄办江南机器制造总局，并主持翻译馆，徐建寅参与了翻译近代科学书籍的工作，翻译出《化学分原》、《声学》、《电学》、《兵学》、《器象显真》、《石板印法》、《造铁全法》、《汽机新制》等科学、兵法新书二十多种。同治十三年（1874），李鸿章创办天津制造局，调徐建寅负责研制火药必需的硝酸。徐凭借对化学的丰富理论知识和实验技术，很快研制成功，且比进口货便宜许多。光绪元年（1875），徐建寅奉调山东机器局总办，“躬自创造，未尝延用西人”，建成一座新型枪炮弹药工厂。光绪五年（1879），徐建寅以驻德参赞名义，到德、英、法考察造舰及军事工业。徐建寅在欧洲对资本主义近代工业进行了认真的考察，仔细了解生产过程和设备运转，工人操作细节，把他认为对中国有参考价值的东西都记录了下来。在他逗留欧洲期间写的《游欧杂录》中，他详细介绍了许多当时世界上最先进的金属加工工艺和设备，如模锻、挤压、冲制成型、仿形切削、转炉炼钢、电冶铜等等，有的笔记几乎同技术文件没有区别，对中国近代工业的发展，产生了十分有益的启示和影响。戊戌变法时期，徐建寅以其丰富的科技知识和实践，被派任新设立的农工商总局督理。但戊戌政变后，许多新事物被扼杀，农工商总局亦被载撤。徐建寅后来受张之洞之邀，到湖北帮助兴办工业和训练新军，八国联军入侵中国后，外国停止向中国供应火药，徐建寅遂赴汉阳钢药厂研制硝化纤维无烟火药。徐建寅认为：列强交迫，军火尤为重要，所以殚精竭虑，夙夜赶制，“日手杵臼，亲自研炼”，终于试制成功，并准备大量生产。光绪二十七年（1901）二月十二日，徐建寅与工匠们一起拌和药料，不想机器磨擦过热，生火炸裂，声如霹雳，火焰冲天，徐建寅与在场的另十三人同时遇难。

光绪二十七年（1901）八月，两江总督刘坤一、湖广总督张之洞会奏变法，议及兴办学堂，先行设局编译教科书。二十日，清廷命刘坤一、张之洞按会奏所陈，择要举办。当月，编译教科书的机构成立，该局设在江宁，初名江鄂书局，后改江楚书局。刘世珩为总办，缪荃孙为总纂，陈作霖、姚佩珩、陈汝恭、柳诒征为分纂。书局成立后即开始编译书籍。罗振玉、刘大猷、王国维在上海翻译日本书籍。另由陈季同、陈庆年先后主译西书。

光绪二十八年（1902），夏曾祐撰写的《最新中学中国历史教科书》完稿。这部教科书只将中国古代史写到隋朝，但却是近代中国人用进化论观点指导历史研究的第一次尝试。在该书中，夏曾祐把中国历史置于上古、中古、近古连续发展的过程中去思考，强调古今事变的因果联系，并将其反封建专制主义思想贯穿于全书。该书最引人注目的是关于历史分期的见解。其中“中国五千年之历史，战国为古今之大界”，并具体分析了战国时期各种改革，认为其中的军政改革，“此事与家族社会与国家社会不同之界，较他事为尤甚”，实为战国封建说的初次猜测。其中“清代二百六十一年为更化时期：此期前半，学问政治，集秦以来之大成；后半，世局人心，开秦以来所未有。比盖处秦人成局之已穷，而将转入他局”。道光以后，与天下相见，数十年来，乃骎骎有战国之势，于是识者知其运将转矣。实为划分古代与近代史分期的首次尝试，是近代史学史首出的卓见。夏曾祐还在书中“历史之益”一节中，强调“夫读史之人，必悉其史中民陈，引归身受，而后读史乃有益”，即让人从史书中汲取教益。这部从形式到内容都十分新颖的历史书，使人耳目一新，深得当时读者欢迎。

光绪二十八年（1902）十一月二日，清政府宣布自下一年会试开始，凡一年授职翰林院修撰、编修者，二、三年改翰林院庶吉士，用部属中书者，皆必须入京师大学堂分门肄业。“必须领有卒业文凭，始咨送翰林院散馆”，以备录用。知县签分到省，也必须入各省课吏馆学习。