嘉庆二年（1797），兼资文武、六艺旁通的女科学家王贞仪病逝，年仅二十九岁。王贞仪，字德卿，自号江宁女史，江苏江宁（今南京）人。她的祖父王者辅是一位具有历算学术中下级官吏，曾任丰城知县和宣化知县，先后都因得罪上官落职，最后一次还被发配到吉林，病死在戍所。她的父亲王锡琛是科举道路上的失意者，但却是一个有学识的好医生，曾汇集自己的临床经验，撰成《医方验钞》四卷。出生于这样环境的家庭里，王贞仪对世态人情比较敏感，对于现实生活有自己独特的考虑和认识，思想中的某些方面突破了当时社会的桎梏，表现出一定的解放和进步倾向。她否定相沿已久的男尊女卑的封建观念，无情地揭露了当时社会上的种种封建迷信活动，从不掩饰自己的观点来阿世取容。在祖父和父亲的熏陶培养下，王贞仪在青年时代不仅具备了经史诗文的修养，而且还在天算、医药等方面具有较高的科学水平，成为清代乾嘉时期一位卓越的女科学家。她广泛地涉猎了古代著名天算家张衡、祖冲之等人的著作，对某些理论和实践问题进行了阐发和解释。王贞仪研究了勾股、测量、方程各方面的学术，写下了许多天算方面的著作。针对当时历算有中西法不同流派，她主张集思广益，不要有门户之见。王贞仪还对天文学中的若干天象问题作了阐述和解释，对岁差等问题提出了个人的见解。她还反复阐述了地体浑圆的论点，解释了人在圆形体上环立而不倾跌的原因，是地球周围都处在和天体的相对空间关系之中，没有上、下、正、侧的区分。在医学方面，王贞仪不仅从医书中学习了医理，而且还能切脉治方，提出了察脉、视人、因时、论方、相地的医道五诀。王贞仪撰写了许多科学专著和诗文集。主要的有《星象图释》二卷，《书算简存》五卷、《筹算易知》、《沈疴呓语》各一卷，《象教窥余》四卷，《文选（诗赋）参评》十卷，《德风亭初集》十三卷，《德风亭二集》六卷，《绣紩余笺》十卷。

嘉庆二年（1797）五月十二日，王聪儿、姚之富领导的襄阳白莲教起义军，在陕南兴安（今安康）与紫阳之间白马石抢渡汉江成功。此前，起义军活动在陕西南部的秦岭山区。后来，王聪儿、姚之富与王廷诏、李全等三路义军会师于镇安，在表带铺击败清军，击毙清军护军统领阿尔萨瑚等，接着又在王家坪设伏，重创清军。五月初，起义军由汉阴、石泉直趋紫阳，抢渡汉江。紫阳白马石等处，居汉江上游，水深不过三、四尺，船只只载义军中的老幼妇孺，其余多系骑马浮渡。身体强壮的战士，每两人挽手划水而过，渡江场面甚为壮观。襄阳义军渡江五天以后，清军统帅惠龄才率领军队缓缓而来。嘉庆皇帝又气又急，大骂惠龄等人是无耻已极，传旨严行申饬，惠龄被夺官街、世职、花翎，降为领队，而以宜绵总统军务，惠龄听其节制。襄阳义军顺利渡过汉江，为进军四川铺平了道路。王聪儿等率领白莲教起义军兵分三路进入四川，穿越大巴山区，到达通江、达州，不久又由通江竹峪关进抵东乡，与四川义军会合。王聪儿、姚之富等驻开县南天洞，李全等部驻温汤井，分屯山冈，延亘三十余里。各路义军决定重新设青、黄、蓝、白分号，并设掌柜、元帅、先锋、总兵等职，确立各路义军的建置。襄阳义军黄号以王聪儿、姚之富、王廷诏、王光祖、樊人杰为首领，白号以高均德、张天伦为首领，蓝号以张汉潮为首领，下面各附以其他将领。襄阳白莲教军抢渡汉江成功，与四川起义军胜利会师，使白莲都起义进入了一个新阶段。

嘉庆二年（1797）十月二十一日，紫禁城内乾清宫、将泰殿发生火灾。次日，嘉庆帝谕内阁、内务府大臣，将失火延烧的太监，以及失于稽察的总督首领太监等，分别治罪。嘉庆帝说：宫禁重地，该太监等不能小心看守，以致失火延烧，获罪甚重，本应照拟严办，朕仰体上天好生之德，量予从宽。结果，原拟绞决太监郝士通，改为应绞监候，秋后处决。原拟绞候首领太监张士太、刘顺、王进录，免死，发往黑龙江，给索伦、达呼尔为奴。原拟发遣的散众太监二十二名，均免其发遣；其中李从祥、孙天成二名，系专管东暖阁的人，重责四十板，发往吴甸锄草三年；张宽等二十名，俱重责四十板，交总管分拨当差效力。至于专管总管太监顾进朝，革去总管，仍回瀛台，在太监上当差，并罚钱粮六年。总管太监萧得录、张进喜、刘芳、佟安、佟玉明，虽均系总管，但究非专司，俱免其革去顶带，仍各罚钱粮四年，以示薄惩。不久，嘉庆帝又命军机大臣传谕刑部，将太监郝士通发往黑龙江，给打牲乌拉、索伦、达呼尔为奴。

嘉庆二年（1797）正月二十六日，贵州布依人起义的消息报闻京师。贵州南笼府（今安龙布依族苗族自治县）布依族人以韦朝元为首，汉人桑鸣升为军师，率领布依、苗、汉人于普坪起义。不久，起义军势力延及安顺府属郎岱、归化（今贵州紫云苗族布依族自治县）和贵阳府属广顺、罗斛（今贵州罗甸）等厅州地区。嘉庆帝闻讯后，立即谕示军机大臣，认为贵州苗疆关系紧要，一切调度机宜，人少照料难周，决定派将军勒保从黄柏山出发，轻骑减从，驰赴南笼；又派珠隆阿、张玉龙等带领从别省调往贵州军兵，前赴南笼；还决定再从别省调兵一二千人驰援贵州南笼，以期火速扑灭布依人起义。后来，在清军四面围剿下，韦朝元等人被俘身死，起义失败。

嘉庆三年（1798），著名文学家袁枚病逝。袁枚，字子才，号简斋，杭州人。乾隆四年（1739）进士，授庶吉士，任知县。由于他个性好味、好色、好葺屋、好游、好友、好花竹泉石、好珪章彝尊，好名人字画，好书，便辞官自适，在南京小仓山修葺随园居住，赋诗作文。袁文著述有《小仓山房文集》及外集四十三卷，《小仓山房诗集》及补遗三十九卷，《小仓山房尺牍》十卷，《随园诗话》及遗补二十六卷，《随园随笔》二十八卷，《新齐谐》及续二十四卷。袁枚的思想比较自由解放，对当时统治学术思想界的汉、宋学派都有所不满，而特别反对汉学考据。他主张诗写性情，认为诗人不失赤子之心，作诗不可以无我，即要有真性情，要有个性。在袁枚看来，性情是诗的根本，一切题材内容，音韵格律、语言风格等，都是有定而无定，恰到好处即妙。他宣称对于古今人诗作，对于各个流派，要无所不爱，无所偏嗜，主要看他们有无表现性情。他反对模仿唐宋、大谈格律、以书卷考据作诗的拟古主义和形式主义诗风，更不喜爱一切迭韵、和韵、作僻韵、用古人韵等等来束缚灵性，以文字为游戏。袁枚对于诗的见解，对当时形式主义和拟古主义诗风，是一个很大的冲击。由于袁枚的诗直抒性情，写自己的生活感受，因而具有清新灵巧的风格。他的许多诗意境明晰，别有韵味。不过，缺乏现实社会内容，所作不出家居生活或旅行纪事的范围，则是袁枚诗的根本缺点。

嘉庆三年（1798）三月，襄阳白莲教军首领王聪儿等在郧西上津堡南投崖壮烈牺牲。原来，襄阳白莲教军准备进攻西安，因清军在川陕有较多机动兵力，尤其地方乡勇众多，这一计划无法实现，王聪儿等便准备率队转移。不料清军死死缠住白莲教军不放，使襄阳白莲教起义军逐渐陷于被动地位。在清军的追逐下，白莲教义军先是在山阳的石河、宽坪与清军激战，接连失利后，又且战且走，退到湖北郧西的三岔河。这里两旁都是高山峻岭，白莲教军被迫走进山沟，如果义军从沟口奔向大路，就可毫无阻挡，摆脱清军追击。谁知郧西知县孔继檊率领数千乡勇，赶在白莲教义军的前面，堵住了沟口。白莲教军被装进了口袋里，前有乡勇堵截，后有清军追赶，两侧都是山梁。既使在这种情况下，八九千名白莲教军仍然顽强奋战，占住山梁，奔突沟口。但是，多次冲击，未能突出包围，白莲教军只好集结在左右两个山梁上。清军侦察到王聪儿、姚之富被困在名为卸花坡的左山梁上，便全力攻扑。王聪儿等率领三千多名白莲教军战士一边放枪，一边滚石抵抗。清军和乡勇人多势众，蜂拥而上，白莲教军中有许多老弱妇幼，力战不支。王聪儿和姚之富率领义军转移到山梁最险峻的地方，弃马爬越。清军团团围住了山梁，白莲教军无路可走，仍奋力抵抗，纷纷倒在血泊之中。王聪儿率领女战士十余人，与姚之富等登到山顶，誓不做俘虏，不受侮辱，相继投崖，壮烈牺牲。当时王聪儿年仅二十二岁。

嘉庆三年（1798）十一月，四川白莲教军重要首领罗其清被清军俘获。罗其清，四川巴州（今巴中）人，父子兄弟均习白莲教。嘉庆元年，他在方山坪起兵，被推为元帅，称巴州白号，以苟文明为副帅，与达州徐天德、东乡王三槐相响应，又联结通江冉文俦、太平龙绍周为左右翼。方山坪四面陡峻，坪顶宽广，上有水田、池塘、房舍，罗其清率领队伍在这里和清军对抗。他还率兵两破巴州，声名大震。嘉庆三年六月，罗其清与冉文俦在营山扎寨，防守严密，无懈可击。但是，罗其清与冉文俦不能团结合作，在几次战斗中，二人分别被清军击败，于是，罗其清被迫放弃箕山基要，退据大鹏寨，在清军的包围中，开始了更为艰苦的斗争。大鹏山地势险绝，宽广一百余里，半属悬崖，山上水泉堰塘很多，易防难攻。十月，清军四路围攻大鹏寨，昼夜轰击，纵火焚寨。经过一个多月的激战，清军从南、西两面突破了山寨。罗其清率部撤退，且战且走，退据虚空寨后，再次被清军包围。因为虚空寨无粮无水，无法防守，又被迫突围至方家坪。在这期间，白莲教义军遭受了严重挫败，溃散殆尽；罗其清也被清军俘获，不屈而死。罗其清死后，四川白莲教军余部由苟文明率领继续斗争，转战巴州各地。后来，在一次战斗中，苟文明、冉文俦同时战败身亡。

嘉庆三年（1798）八月初九日，清军统帅勒保上奏嘉庆帝：白莲教军重要首领王三槐已被俘获。王三槐是四川白莲教军首领，称东乡白号。该部是四川省白莲教起义军的主力，被清政府认为是最强悍的一支。嘉庆三年初，王三槐率领白莲教军，与清军大战于云阳、开县之间，切断了清军的粮道，使清军缺饷两月，乡勇四散。后来，王三槐又率领四川白莲教军与清军激战于开县梓橦庙、九龙山、铁索桥，以及太平金盆池，使清军总兵朱射斗惨遭败绩，清军大炮丢弃沟渠，被白莲教军缴获，均丢入金盆池中。王三槐虽然作战勇敢，指挥有方，但是，他对清朝统治者的招抚、诱降阴谋却认识不清。他过分相信南充知县刘清，赞誉他是不欺压百姓的“刘青天”。他曾跟随刘青进入清军统帅宜绵大营，企图用诈降手段袭击清军，只是清军有所准备，才未能得手。王三槐率领四川白莲教军击败朱射斗以后，便在太平、开县之间与清军周旋。清军将领勒保不能战胜王三槐，便设下毒计。他派遣都司马龙和贡生刘星渠两人，进入安乐坪劝说王三槐谈判招安事。王三槐依仗以前去过清军大营，并没出事，便把刘星渠留作人质，而随马龙前往。结果，王三槐进入清军大营后，即被逮捕。后押解京师受审，招出《供单》，被凌迟处死。王三槐死后，四川东乡白号白莲教军在冷天禄率领下，继续和清军进行斗争。

嘉庆四年（1799）八月二十七日，洪亮吉因事革职，不久遣戍伊犁。洪亮吉，字稚存，江苏武进人，少年孤贫，奋力学习。乾隆五十五年进士，授翰林院编修。后督贵州学政，任满还京，入直上书房。嘉庆三年大考翰詹，他力陈内外弊政数千言，为时人所忌，以弟丧辞归。不久，大学士朱珪上书建议，重要起用。洪亮吉遂致书成亲王永瑆，称十几年来，督、抚、藩、臬贪欺害政，比比皆是。官吏贤者斤斤自守，不肖者亟亟营私。国计民生，毫不考虑，只顾目前；官民吏治，不认为是急务，只图保住自己的官。洪亮吉还直接指出：当今皇上应当效法宪皇帝的严明，使吏治肃而民乐生。结果，嘉庆帝认为他“妄测高深，意存轩轾，狂谬已极”，不仅把他革职，还遣戍伊犁。嘉庆五年，因为京师发生旱灾，洪亮吉才被释回籍。此后，洪亮吉专心著述。他精通经史，长于音韵、地理学及诗文，他曾提出人口繁殖与生活资料，如住房、粮食等增长率的不协调，所以“治平”时代潜伏着社会危机。他的要主著述有《春秋左传训诂》、《补三国晋书地理志》、《意言》等，大多汇编于《洪北江全集》。

嘉庆四年（1799）四月十九日，嘉庆帝就宛平百姓潘世恩、汲县百姓苏廷禄呈请在直隶邢台等县境内开采银矿，给事中明绳据以入告事颁布谕旨。他说：朕恭阅世宗宪皇帝朱批谕旨，于开矿一事，深以言利扰民为戒。圣训煌煌，可为万世法守。矿藏于山，非数人所能采取，亦非数月所能完事。必须是千百人为群，经年累月，设立栅厂，凿砂煎炼。以谋利之事，聚游手之民，生衅滋事，势所必然。纵使官府经理，尚且难以约束多人，若听一二商民集众自行开采，其弊将无所不至。这在边疆省份犹不可行，何况近在畿辅？他府犹不可行，何况近地大名？各该处向有私习邪教的人，此时对他们禁止尚旦不够，怎么又能听任他们聚众呢？国家经费，自有正供常赋，川陕民乱，指日即可平定，国用本用不着考虑，怎么能又穷搜山泽，锱铢计较呢？结果，潘世恩、苏廷禄以“藉纳课为词，以小民而议及帑项，实属不安本分”罪，押回原籍，交地方官严行管束，不许出境滋事。给事中明绳，以开矿事冒昧转奏，明系商人嘱托，希望事成后分肥而已，用心卑鄙，交部议处。这样，清政府就明确表示了畿辅地区禁止开采银矿以及其它矿藏。