顺治四年（1647）三月二十四日，《大清律》修成，颁行全国。《大清律》是在清廷入关后，承袭《大明律》而编写的清朝第一部成文法典。由于它在一定程度上是《大明律》的翻版，与清初现实的情况相脱节，所以在颁行之初并未认真执行。又由于《大清律》竭力维护满官的特权地位，吏部对处分满官没有律例可行，导致吏治渐趋腐败。为整饬吏治，顺治十二年，清廷决定参照明朝的会典，编为“简明则例”。康熙二十八年（1689），清廷将现行则例附入《大清律》，使《大清律》日趋完备。

顺治四年（1647）十二月二十四日，清廷规定长城应留台座和设兵丁之数：长城自张家口关门至西黄河至东，共一千四十五里，应留台二百四十四座，每台设军丁三名，共七百三十二名，其余台一千三十二座不用；又自张家口起东至山海关止，共二千四百四里，应留台四百一十七座，每台设军丁三名，共一千二百五十一名，余台二千四百五十座不用。另，凡系捕鱼网户耕种往来之路及民间运木之路及，与鄂尔多斯部交易之地共留关口八处，其常峪、独石等十一口均堵塞。

顺治四年（1647）八月二十八日，清廷制定了绿营兵月饷：每名每月凡有马战兵二两，无马战兵一两五钱，守兵一两。不久又规定，不论战守之马步兵，每名每月均加给米一斗。

顺治四年（1647）琉球国中山王尚贤病逝，弟尚质自称世子，“遣使奉表归诚”。顺治十一年（1654）三月初七日，尚质遣使进贡方物，缴故明所封敕印，并请颁新敕印。七月初一日，顺治帝遣兵科副理事官张学礼等携敕印封尚质为琉球国中山王，赐其王印一、缎币三十匹、妃缎币二十匹；并颁定贡期：每二年一贡，进贡人数不得超过一百五十名，允许正、副使二员及从人十五名入京，其余人员俱留福建待命。

顺治四年（1647）底，江西、广东的降清明将金声桓、李成栋在当地抗清形势的影响和鼓舞之下，倒戈抗清。金声桓，原为左良玉手下麾将，后随其子左梦庚降清，率军进据江西。自以为功高无比，不但未封公候，只得了个江西提督总兵官，并且还受到巡抚章于天的监视和牵制。顺治五年（1648）正月二十七日，金声桓举兵叛清，杀死章于天，出榜安民，拥护永历政权，又派人劝说两广提督李成栋。接着，金声桓攻下九江。由于他拒听谋士的劝告，未能溯江而上，控制长江的上游，反而率师攻打赣州，误中了清军的缓兵之计，使清军赢得了喘息的时间。不久，清都统谭泰率军自江宁（今南京）进讨，连陷九江、饶州，金声桓狼狈回师南昌，困守孤城。次年（1649）正月十九日，清军攻陷南昌，金声桓在其府中投水死。李成栋，原为史可法部将，后率军隆清，他在顺治三年率清军攻打广州的战斗中立在汗马功劳，但是因求授高官不得，于顺治五年（1648）四月初十日叛清归明，亲迎永历帝至广东，然而他未能利用当时大好的抗清形势，出兵江西和金声桓的力量汇合，反而忙于在永历小朝廷内争权夺势。当清军围困金声桓于南昌时，李成栋受永历帝之命前往救援，在赣州之役中误中敌计，先自策马奔逃，被迫退往赣州的信丰。顺治六年二月被清军包围。二十六日李成栋率领所部在突围时渡涧溺死。

顺治六年（1648），《明史》总裁刚林鉴于清初明朝官方史料散失殆尽的教训，建议六科每月汇集奏折及谕旨录送史馆，由翰林官分别编纂，供修史时采用，得到了摄政王多尔衮的批准。清朝由此建立起按月编纂六科史书的档案制度。

顺治五年（1648）十一月十一日，顺治帝下诏旨说，满族贵族自开国以来，屡世出征，著有劳绩；命各部将他们分别升叙，实授官员，一概给与世袭诰命。这个规定，使满族贵族不仅本人获得了特权地位，而且可以传给子孙后代，并使这种特权地位永远继续下去。

顺治五年（1648）十一月初八日，清廷追尊太祖努尔哈赤以上四世为帝后：高祖泽王为肇祖原皇帝，母为原皇后；曾祖庆王为兴祖直皇帝，母为直皇后；祖昌王为景祖翼皇帝，母为翼皇后；父福王为显祖宣皇帝，母为宣皇后。十一日，诸王大臣纷纷上表章称贺。顺治帝于是颁诏，大赦天下。其诏条例共四十款。其中规定：豁免顺治元年至三年百姓拖欠的钱粮；逃人及其隐匿者，凡于顺治六年八月以前自归免罪，九月以后自归或被人告发者不免罪；惩治贪官污吏；对灾民实行蠲免。

顺治五年（1648）八月十五日，清廷鉴于各地抗清义师“偷制器械，私养马匹，毒害良民，作为叛乱”，禁止民间蓄养马匹、制造或私藏军器。规定：民间蓄养的马匹，地方官估值给价，作为清军坐骑；甲胄、枪刀、弓矢器械，可用者收贮，不可用者尽行销毁；有不遵禁谕私自隐匿兵器、马匹者，均作“叛逆”，一经查出或被告发，本人处斩，家产妻孥入官，邻佑十家长杖流；凡习武生童及武举等，只许马一骑、弓一张、披子箭九枝，不准用梅鍼箭，如借人事发治罪。顺治十二年（1655）九月初十日，清廷又重申禁止私贩马匹：嗣后蒙古卖马，只许各旗兵丁人役买用。如有马贩私买者，凡属满人则责成固山额真、梅勒章京等，汉人则责成五城并司坊等官严行禁缉。如禁缉不严，被人捕获，将所贩之马三分之一给捕获之人，余皆入官，牛录章京、骁骑校、小拨什库、司坊等官及贩卖者、买养者一并下刑部从重议罪。

顺治五年（1648）八月二十日，清廷下谕旨说，当今天下一家，为使满汉官民互相亲睦，允许缔结婚姻。九月十三日又规定：嗣后凡满洲官员之女欲嫁汉人者，须先呈报户部；其无职者之女，凡部册有名者，令各牛录章京报户部后方能出嫁，无名者听各牛录章京自行遣嫁；汉官之女欲嫁满人者，也要报户部，无职者听其自便；满洲官民娶汉人之女，实系为妻者，方准其娶。